Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg16l1Q8C0J2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms