Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Smim19Q80ZU4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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