Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ckap2lQ7TS74 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms