Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN22

Txndc16, Thioredoxin domain-containing protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc16Q7TN22 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Txndc16Q7TN22 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Txndc16Q7TN22 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms