Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms