Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pcp4l1Q6W8Q3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms