Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nptx1Q62443 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nptx1Q62443 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nptx1Q62443 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms