Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm1Q60636 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms