Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms