Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynaQ5G5D5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms