Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nr1d1Q3UV55 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nr1d1Q3UV55 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms