Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PDE6HQ13956 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PDE6HQ13956 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PDE6HQ13956 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PDE6HQ13956 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6HQ13956 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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