Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5Q00535 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms