Protein–RNA interactions for Protein: P34968

Htr2c, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr2cP34968 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr2cP34968 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms