Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb1P17919 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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