Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01653 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01653 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01653 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
P01653 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01653 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01653 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01653 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01653 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01653 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01653 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01653 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01653 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms