Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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