Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Sdc4O35988 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc4O35988 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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