Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited2O35740 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited2O35740 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited2O35740 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms