Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc146E9Q9F7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms