Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms