Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChmQ9QXG2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChmQ9QXG2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms