Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms