Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt1Q9JMD1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms