Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slco1c1Q9ERB5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms