Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsc1Q9EP53 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms