Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrameQ9D4Z5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms