Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem17Q8K0U3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem17Q8K0U3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms