Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrtm1Q8BXQ3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrtm1Q8BXQ3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrtm1Q8BXQ3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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