Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRINP3Q76B58 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRINP3Q76B58 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRINP3Q76B58 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRINP3Q76B58 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRINP3Q76B58 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRINP3Q76B58 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms