Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SrmQ64674 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SrmQ64674 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SrmQ64674 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SrmQ64674 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SrmQ64674 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrmQ64674 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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SrmQ64674 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrmQ64674 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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