Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcolceQ61398 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms