Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms