Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SP6Q3SY56 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SP6Q3SY56 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SP6Q3SY56 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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