Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdgfl1Q2VPR5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl1Q2VPR5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms