Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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