Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc1Q0VDN7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc1Q0VDN7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms