Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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