Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3eP60229 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3eP60229 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms