Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casp8O89110 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms