Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3542K7N6U2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3542K7N6U2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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