Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp408H7BX78 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms