Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Usp9yF8VPU6 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Usp9yF8VPU6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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