Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARFGAP3Q9NP61 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms