Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed6Q9CQG0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms