Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYCP2Q9BX26 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCP2Q9BX26 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms