Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NsmfQ99NF2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.4 ms