Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRG3Q99928 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms