Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPZA3Q96KX2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms