Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms